分享几个化学结构图像式识别工具 #S040

原创风清扬华山后山

2024年09月08日 15:33

对人工智能来说，图像识别早就不算什么新鲜事了。化学分子结构式的识别也属于这一领域，近年来也有不少相关的工具问世。

简单来说，就是在照片上、网络上、文献中、手机拍照中，你看到一个或若干个化学结构式，想把它转换成chemdraw可编辑的文件，而不用手工一个个去画到chemdraw中，这时候，需要用到这类计算机工具（软件、程序）。

自己画也不是不行，笔者就喜欢自己画，但那是一两个的时候，如果文献中很多，flora决计是不想画的，俗话说，“懒，是科研第一驱动力”。因此，我就想找一些工具来解决这个痛点。

这一年来玩AI，也学了不少计算机环境部署知识，现在再看github中的开源程序，也不像之前那般一头雾水。比较有名的列举如下。

开源分子图像识别程序

DECIMER

https://github.com/Kohulan/DECIMER-Image_Transformer

Img2Mol

https://github.com/bayer-science-for-a-better-life/Img2Mol

OSRA

https://github.com/metamolecular/osra

MolScribe

https://github.com/thomas0809/MolScribe

这些都挺强大的，但小白使用的确有很高的门槛。需要具备计算机环境部署知识，并且要掌握科学上网的技能，部署完成后，在本地计算机可以使用，无需再用网络。环境部署对国内人员来说简直太不友好了。

为了解决计算机小白不适用的问题，很多头脑灵活的人，通过上述开源程序，制作了软件和网站，供大家使用。但有一个缺点，就是需要“花钱”，有的需要注册，有的需要充会员，你懂的。毕竟人家辛辛苦苦做出来的，就是为了挣钱的。有个词叫做套壳，什么叫套壳，这就叫套壳（没有抨击的意思，外行觉得这是贬义词，内行直呼厉害，能赚钱就是王道）。

一些分子识别软件

StoneMIND Collector

https://stonewise.cn/mol_product

Img2Chem

https://www.fulmz.com/img2chem.html

InDraw

https://www.integle.com/static/indraw

重点来了，开源+免费，而且不用注册，不用花钱的，还真被我找到一个，就是第一个开源程序，他们自己做了一个网站。

唯一缺点就是需要上网，能正常国内上网就行。但这也算不上什么大缺点。有人不禁要问，操作一个东西，需要上网算是缺点吗？还真是。因为有些地方，是禁止上网的，上网，代表着可能存在隐私（信息）泄露的风险，不展开了。

网址：https://decimer.ai/

界面如下

点击页面中间灰色部分“drop PDF document or chemical structure images here,or click to select files”，便可上传文件或者图片，等待几秒，就转换完成了，无论是1个还是多个。

完成后如图所示，选择红圈处的按钮下载即可用chemdraw打开，也可以点击上方download下载png、txt、mol格式的文件。

虽然识别准确率相当之高，但还是建议检查一遍，如果有问题，自行微调即可。大大提高了效率。

如果想开启新的一个转换，点击页面右上角reload即可。

都看到这里了，给自己点个赞吧~

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